يدور أنمي مذكرة الموت (Death Note) حول طالب الثانوية العبقري ياغامي لايت، الذي يعثر على مذكرة غامضة تسقط من عالم "الشينيغامي" (آلهة الموت). يكتشف لايت أن المذكرة تمتلك قوة خارقة: أي شخص يُكتب اسمه داخلها وهو يعرف وجهه يموت فوراً بالسطة القلبية (أو بالطريقة التي يحددها الكاتب). ​يبدأ لايت بالاستخدام الخفي للمذكرة للقضاء على المجرمين حول العالم لخلق عالم مثالي خالٍ من الشر يحكمه بنفسه، وتطلق عليه الجماهير ووسائل الإعلام اسم "كيرا". ​تتطور الأحداث عندما تلاحظ الشرطة الدولية الوفيات الغامضة للمجرمين، وتستعين بـ "L"، المحقق العبقري الغامض الذي لا يعرف أحد هويته أو شكله. تبدأ عندها صراع عقول وملحمة ذكاء بين لايت وL، حيث يحاول L كشف هوية كيرا وإثبات تورطه، بينما يسعى لايت لمعرفة اسم L الحقيقي للتخلص منه واستكمال مخططه.